弼认为平辽军的名称不妥，会损伤辽东本地人心，建议改为征东军这件事王化贞更不满意王化贞认为熊廷弼瞧不起他，是在故意损坏他的威信王化贞总想主动出击，尽快平定辽东熊廷弼却主张防守反击一来二去，两人矛盾越来越深
天启元年年底，内阁首辅方从哲告老还乡王化贞的老师，东林党人叶向高升任首辅在朝中东林党的全力支持下，王化贞拿到前线指挥权，彻底不再听从熊廷弼的指挥
天启二年二月，王化贞无视熊廷弼要他坚守广宁的命令，悍然发动广宁战役他梦想策反后金大将李永芳，一举击败后金可他没想到，他身边的亲信将领孙得功却是后金的奸细，他的一举一动后金都了如指掌他的美梦正是孙得功帮忙编织的结果，王化贞美梦破灭，广宁战役明军惨败，王化贞也差一点当了俘虏缺兵少将的熊廷弼，直接下令放弃关外撤回山海关
孙承宗调查后认为，虽然是迫不得已，但熊廷弼不战而退，擅自放弃关外大片土地也有错误，应负次要责任给事中明时举、御史李达招兵失当也有责任辽东巡按方震孺、登莱监军梁之垣、蓟州兵备邵可立在战争期间举止失当，引起驻军惊慌也当受罚
至于辽东经略王在晋制定的，在山海关外八里铺修建新城的计划，更被孙承宗全部否决孙承宗认为，明军应该趁后金撤兵，返回辽沈休养生息之际，前出山海关，把防线推到宁远一线，沿途修建工事，以守代攻，伺机收复锦州，把后金锁死在辽东大地
孙承宗调查中敏锐的发现，现在的明军，已经完全失去了与后金军野战的能力基于这个认识，他也为熊廷弼的决断暗中叫好孙承宗认为，尽管当初熊廷弼不经朝廷同意，就断然撤退，在政治上是错的可如果没有熊廷弼撤走所有溃兵、难民，带走了所有的物资，也许后金已经把战火烧到山海关了正因为后金在关外几百公里范围内，找不到任何补充资源，才会黯然撤兵
不过，孙承宗是绝不赞成熊廷弼完全放弃关外，屯兵山海关、登莱和皮岛，伺机三路攻击后金的方略他认为，现阶段明军已经无力野战勉强发动攻势，只会重演萨尔浒之败
如果没有攻势，只固守山海关，那等到后金消化完广宁之战的战果后，他将完全占据关外那个时候山海关和皮岛相距过远，根本无法形成有效配合山海关离京师实在太近了，一旦有失将会天下震动大明是天子守国门，可也不能让天子去天天守着国门啊熊廷弼政治方面不太及格
孙承宗的完美构想是，趁后金退兵修养之际立即前出抢占宁远依靠宁远、觉华岛建立一条防线，把防线前推到200里外，确保山海关的战略纵深沿途建立遥相呼应的战略据点，以守代攻，逼后金